Nicht nur die Verteilung der Wassertemperaturen im Indischen Ozean ähnelt denen im Pazifik, sondern auch die Veränderung des ozeanischen Kreislaufs. Der Monsun ist in ein komplexes System aus Temperaturen, Wind und Meeresströmungen eingebunden, dass sowohl die Niederschläge in Indien und Afrika bestimmt, als auch die Wassertemperaturen vor Indonesien und die Verlagerung der Wassermassen beeinflusst.
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Im Osten des Indischen Ozeans steigt vor der indonesischen Küste kühleres Wasser an die Oberfläche während sich im Westen vor der Küste Afrikas warme Wassermassen sammeln. Meeresströme nördlich und südlich des Äquators transportieren das frische Kaltwasser von Osten nach Westen und gleichzeitig führt der Äquatoriale Gegenstrom warmes Wasser von Afrika nach Asien.
Der Nord-Äquatorialstrom kann sich jedoch nur schwach ausbilden, weil die Spitze des indischen Subkontinents den Ozean in zwei nördliche Becken teilt: den Golf von Bengalen und das Arabische Meer. Wie ein „Fähnchen im Wind“ ist der Strom daher abhängig vom Monsun: Der Nordostwind im Winter unterstützt die Strömung und treibt das Wasser von November bis März nach Westen – doch ohne die Hilfe ändert sie die Richtung und fließt im Sommer genau entgegengesetzt nach Osten.